В основном Двигатель и регулятор припаиваются намертво, за редким исключением существует система соединения на винтах, но я думаю что тебе пока это не надо.
Да ты правильно понимаешь, надо чтобы разъемы были одинаковые на регуляторе в сторону батарее, на батарее и на заряднике соответственно.
По поводу 2 провода на батарее, да это балансировочный провод и подключается на зарядник.